Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8BQ9ULN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms