Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL6Q9UKU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL6Q9UKU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms