Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABGEF1Q9UJ41 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms