Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHF11Q9UIL8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms