Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MLH3Q9UHC1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MLH3Q9UHC1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
MLH3Q9UHC1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MLH3Q9UHC1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms