Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDP1Q9P0J1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDP1Q9P0J1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDP1Q9P0J1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms