Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NECAP2Q9NVZ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms