Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM10Q9NQV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM10Q9NQV6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM10Q9NQV6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms