Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUDS3Q9H7L9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUDS3Q9H7L9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms