Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms