Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO4Q9GZR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO4Q9GZR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REXO4Q9GZR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms