Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VN1R3Q9BXE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VN1R3Q9BXE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VN1R3Q9BXE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms