Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF649Q9BS31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF649Q9BS31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF649Q9BS31 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms