Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAAF1Q9BRP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAAF1Q9BRP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAAF1Q9BRP4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms