Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHF12Q96QT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.1 ms