Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA13Q96N96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPATA13Q96N96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA13Q96N96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms