Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01600Q96MT4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01600Q96MT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms