Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00615Q96LM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00615Q96LM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms