Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALR3Q96L12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALR3Q96L12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALR3Q96L12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms