Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF479Q96JC4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms