Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC34Q96HJ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms