Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE23Q8NDY6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE23Q8NDY6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE23Q8NDY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms