Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF38AQ8NAV1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38AQ8NAV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms