Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC01555Q8NAE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms