Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC63Q8NA47 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms