Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC82Q8N4S0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC82Q8N4S0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC82Q8N4S0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms