Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS3Q8IXF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS3Q8IXF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPAS3Q8IXF0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms