Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
STRCQ7RTU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCQ7RTU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
STRCQ7RTU9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms