Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1Q6UXZ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD1Q6UXZ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.8 ms