Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCARA3Q6AZY7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARA3Q6AZY7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms