Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHYHD1Q5SRE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms