Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SOHLH1Q5JUK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms