Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms