Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI3KQ59H18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TNNI3KQ59H18 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNI3KQ59H18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms