Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3L2Q3SX64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3L2Q3SX64 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms