Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROX2Q3B8N5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PROX2Q3B8N5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms