Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
COL24A1Q17RW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL24A1Q17RW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
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