Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA9Q16790 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA9Q16790 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA9Q16790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA9Q16790 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA9Q16790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA9Q16790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA9Q16790 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA9Q16790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA9Q16790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA9Q16790 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA9Q16790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA9Q16790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA9Q16790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA9Q16790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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