Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HIF1AQ16665 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIF1AQ16665 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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