Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNCBQ16143 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNCBQ16143 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNCBQ16143 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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