Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD8Q15843 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8Q15843 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8Q15843 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8Q15843 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8Q15843 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8Q15843 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8Q15843 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8Q15843 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8Q15843 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8Q15843 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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