Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1AQ15573 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1AQ15573 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1AQ15573 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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