Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDC1Q14676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDC1Q14676 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDC1Q14676 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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