Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPARCL1Q14515 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPARCL1Q14515 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms