Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSPB3Q12988 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HSPB3Q12988 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSPB3Q12988 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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