Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLFN5Q08AF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms