Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4F3Q08477 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F3Q08477 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms