Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1Q04771 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1Q04771 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms