Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARDQ03181 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARDQ03181 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARDQ03181 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms