Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFAMQ00059 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAMQ00059 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms